Tenho dois monitores, a minha esquerda o monitor de 22', e a minha direita, o monitor de 19'. Veja:
Veja que o monitor principal está configurado para que seja o da minha direita, ou seja, o de 19'. Contudo, gostaria que o monitor de 22' seja o padrão, através dessa tela de configuração não conseguia ter sucesso, o monitor principal ainda continuava sendo o de 19'.
Após algumas pesquisas consegui a configuração pretendida com duas linhas de comando. Segue:
$ xrandr | grep -w connected
DVI-I-1 connected primary 1366x768+1920+0 (normal left inverted right x axis y axis) 413mm x 234mm
HDMI-0 connected 1920x1080+0+0 (normal left inverted right x axis y axis) 477mm x 268mm
A saída do comando acima detectou o DVI-I-1, que é o meu monitor de 19' e o HDMI-0 o de 22', repare que o DVI está configurado como primary. Vamos trocar para que o HDMI seja o monitor principal:
$ xrandr --output HDMI-0 --mode 1920x1080 --primary --left-of DVI-I-1 --output DVI-I-1 --mode 1366x768
Explicando, usei os dados do primeiro comando para preencher o comando acima. Pela pesquisa que fiz, ao invés de --left-of, tinha visto o comando --right-of, e executei-o, mas tive problemas na exibição entre os monitores. Troquei o comando para o que está acima e deu tudo certo.
Agora, executando o primeiro comando, tive a seguinte saída:
$ xrandr | grep -w connected
DVI-I-1 connected 1366x768+1920+0 (normal left inverted right x axis y axis) 413mm x 234mm
HDMI-0 connected primary 1920x1080+0+0 (normal left inverted right x axis y axis) 477mm x 268mm
Reparem que agora, o monitor principal é o HDMI-0, como pretendido.
--- Editado em 23/12/2015
Apesar da configuração pelo xrandr, para de definir o monitor principal, tive a infelicidade de perceber que tal configuração não persistia ao reiniciar a máquina. Após profundas pesquisas cheguei a uma forma simples de configurar o monitor principal, veja:
Pelo terminal, vá ao diretório
.config
$ cd ~/.config
Edite o arquivo
monitors.xml
$ sudo vim monitors.xml
<monitors version="1">
<configuration>
<clone>no</clone>
<output name="HDMI-1">
<vendor>GSM</vendor>
<product>0x5a26</product>
<serial>0x01010101</serial>
<width>1920</width>
<height>1080</height>
<rate>60</rate>
<x>0</x>
<y>0</y>
<rotation>normal</rotation>
<reflect_x>no</reflect_x>
<reflect_y>no</reflect_y>
<primary>no</primary>
</output>
<output name="VGA-1">
</output>
<output name="DVI-I-1">
<vendor>AOC</vendor>
<product>0x1900</product>
<serial>0x01010101</serial>
<width>1366</width>
<height>768</height>
<rate>60</rate>
<x>1920</x>
<y>0</y>
<rotation>normal</rotation>
<reflect_x>no</reflect_x>
<reflect_y>no</reflect_y>
<primary>no</primary>
</output>
</configuration>
<configuration>
<clone>no</clone>
<output name="DVI-I-0">
</output>
<output name="VGA-0">
</output>
<output name="DVI-I-1">
<vendor>AOC</vendor>
<product>0x1900</product>
<serial>0x01010101</serial>
<width>1366</width>
<height>768</height>
<rate>60</rate>
<x>1920</x>
<y>0</y>
<rotation>normal</rotation>
<reflect_x>no</reflect_x>
<reflect_y>no</reflect_y>
<primary>yes</primary>
</output>
<output name="HDMI-0">
<vendor>GSM</vendor>
<product>0x5a26</product>
<serial>0x01010101</serial>
<width>1920</width>
<height>1080</height>
<rate>60</rate>
<x>0</x>
<y>0</y>
<rotation>normal</rotation>
<reflect_x>no</reflect_x>
<reflect_y>no</reflect_y>
<primary>no</primary>
</output>
</configuration>
</monitors>
Repare que no meu arquivo monitors.xml tem dois trechos com a tag configuration. Procure a que tem a tag primary com o valor yes.
Veja que ela está configurando o monitor DVI como primary, mas eu gostaria que o monitor HDMI fosse o principal. Então troquei a configuração, ficando assim:
...
<output name="DVI-I-1">
<vendor>AOC</vendor>
<product>0x1900</product>
<serial>0x01010101</serial>
<width>1366</width>
<height>768</height>
<rate>60</rate>
<x>1920</x>
<y>0</y>
<rotation>normal</rotation>
<reflect_x>no</reflect_x>
<reflect_y>no</reflect_y>
<primary>no</primary>
</output>
<output name="HDMI-0">
<vendor>GSM</vendor>
<product>0x5a26</product>
<serial>0x01010101</serial>
<width>1920</width>
<height>1080</height>
<rate>60</rate>
<x>0</x>
<y>0</y>
<rotation>normal</rotation>
<reflect_x>no</reflect_x>
<reflect_y>no</reflect_y>
<primary>yes</primary>
</output>
...
Salve o arquivo, reinicie a máquina, e pronto!
OBS: Configuração testada no LMDE2